അമിത് ഷാ ഗുജറാത്ത് ആഭ്യന്തരമന്ത്രിയായിരുന്ന കാലത്താണ് സൊഹ്റാബുദ്ദീന് ഷെയ്ഖിനെ പൊലീസ് പിടിച്ചുകൊണ്ടു പോയതും പിന്നീട് വധിക്കപ്പെടുന്നതും. 2005ലായിരുന്നു കേസിനാസ്പദമായ സംഭവം നടന്നത്. അമിത് ഷായുടെ നിര്ദ്ദേശപ്രകാരമായിരുന്നു വ്യാജ ഏറ്റുമുട്ടല് നടന്നതെന്നും സൊഹ്റാബുദ്ദീന് ഷെയ്ഖ് കൊല്ലപ്പെട്ടതെന്നുമായിരുന്നു കേസ്.