സിസേറിയന് എന്നത് ഒരു വലിയ സര്ജറി എന്നതാണ് ഇതിന്റെ പ്രധാന ബുദ്ധിമുട്ട്. സര്സറി എന്തൊക്കെ പാര്ശ്വഫലങ്ങള് ഉണ്ടാകാന് സാധ്യതയുണ്ടോ അതൊക്കെ സിസേറിയനും ഉണ്ടാകാന് സാധ്യതയുണ്ട്. ബ്ലീഡിങ്, ഇന്ഫക്ഷന്, ബ്ലഡ് ക്ലോട്ട്, എന്നിവയൊക്കെ ഉണ്ടാകാം. മറ്റൊന്ന് ദീര്ഘനാള് ആശുപത്രിയില് കഴിയേണ്ടി വരും എന്നതാണ്.