നിത്യാനന്ദയില് നിന്ന് മധുരമഠം സംരക്ഷിക്കുന്നതിനു വേണ്ടി സര്ക്കാരിന് നിര്ദ്ദേശം നല്കണമെന്ന ആവശ്യവുമായി മധുര സ്വദേശിയായ എം.ജഗദല്പ്രതാപന് മുമ്പ് ഹര്ജി സമര്പ്പിച്ചിരുന്നു. എന്നാല് ഇക്കാര്യവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട് കോടതിയില് നിത്യാനന്ദ നല്കിയ സത്യവാങ്മൂലത്തിലുള്ളതെല്ലാം തെറ്റായ വിവരങ്ങളാണെന്ന് കോടതി കണ്ടെത്തിയിരുന്നു. തുടര്ന്നാണ് നിത്യാനന്ദയെ അറസ്റ്റ് ചെയ്യാന് കോടതി ഉത്തരവിട്ടത്.