കൊടുങ്ങല്ലൂരില് പോരാട്ടം സംഘടിപ്പിച്ച യോഗത്തില് പങ്കെടുത്തതിനാണ് ജോനാഥിനെ മൂന്ന് മാസം മുമ്പ് പോലീസ് അറസ്റ്റ് ചെയ്തത്. സംഭവത്തില് കേസെടുത്ത പൊലീസ് നടപടിയെ ഹൈക്കോടതി വിമര്ശിച്ചു. ജൊനാഥന് യോഗത്തില് പങ്കെടുത്തത് വിസാ ചട്ടലംഘനമല്ലെന്നും കോടതി വ്യക്തമാക്കി.