രസതന്ത്രവും മൈക്രോ ബയോളജിയുമാണ് ലൂയി പാസ്ചറിന്റെ പ്രധാന മേഖലകള്. നഗ്നനേത്രങ്ങള് കൊണ്ട് കാണാന് സാധിക്കാത്ത സൂക്ഷ്മ ജീവികളാണ് പകര്ച്ച വ്യാധികളുണ്ടാക്കുന്നതെന്ന് ആദ്യം തിരിച്ചറിഞ്ഞത് ഇദ്ദേഹമാണ്. പേവിഷബാധ, ആന്ത്രാക്സ് എന്നിവയ്ക്കുള്ള ആദ്യ പ്രതിരോധ മരുന്ന് കണ്ടുപിടിച്ചു. പേ ബാധിച്ച നായയുടെ തലച്ചോറില് നിന്നും വേര്തിരിച്ചെടുത്ത ദ്രാവകമാണ് പ്രതിരോധ മരുന്നായി അദ്ദേഹം ഉപയോഗിച്ചത്.
