പ്രശാന്ത് നായര് ഐഎഎസ് മുന്പും വിവാദങ്ങളില് ഇടംപിടിച്ചിട്ടുണ്ട്. 2021 ല് മാതൃഭൂമിയിലെ മാധ്യപ്രവര്ത്തകയ്ക്ക് അധിക്ഷേപ സന്ദേശം അയച്ചതിന്റെ പേരില് പ്രശാന്ത് ഏറെ വിമര്ശനങ്ങള് ഏറ്റുവാങ്ങിയിരുന്നു. കേരള ഷിപ്പിങ് ആന്റ് ഇന്ലാന്ഡ് നാവിഗേഷന് കോര്പറേഷന് എം.ഡി ആയിരുന്നു പ്രശാന്ത് അപ്പോള്. ആഴക്കടല് വിവാദവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട് പ്രതികരണത്തിനായി സമീപിച്ച മാധ്യമപ്രവര്ത്തകയോടാണ് പ്രശാന്ത് വാട്സ്ആപ്പില് മോശം രീതിയില് സംസാരിച്ചത്. മാതൃഭൂമിയിലെ മാധ്യമപ്രവര്ത്തകയാണ്, ഒരു വാര്ത്തയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട് ഇപ്പോള് സംസാരിക്കാമോ എന്നാണ് മാധ്യമപ്രവര്ത്തക പ്രശാന്തിനു വാട്സ്ആപ്പില് സന്ദേശം അയച്ചത്. നടി സീമ പുറംതിരിഞ്ഞു നില്ക്കുന്ന അശ്ലീല ചുവയുള്ള സ്റ്റിക്കര് പ്രശാന്ത് തിരിച്ചയക്കുകയായിരുന്നു. മാധ്യമപ്രവര്ത്തകെ അധിക്ഷേപിച്ചും പ്രശാന്ത് സംസാരിച്ചിരുന്നു.